薛瑞栋

研究员，博导

邮箱：rxue@bjmu.edu.cn

地址：北京大学医学科技楼西楼802

个人简介

薛瑞栋，研究员，助理教授，博士生导师，国家优青，北京市科技新星，北大博雅青年学者。任职于北京大学-云南白药国际医学研究中心、国际癌症研究院、JDB电子官方网站医学生物信息系及北京大学第一医院肿瘤转化研究中心。2018年在北京大学生命科学学院获得博士学位（BIOPIC白凡组），期间在英国伦敦大学学院UCL/the Francis Crick Institute 访学（Charles Swanton组），而后加入北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组工作（助研/副研），2023年建立独立课题组。

以（共同）第一/通讯作者发表论文13篇，包括Nature（x2）、Cancer Cell、Gastroenterology（x2）等；被多次同期评述及Nat Rev专门评述，获Faculty Opinions推荐，成果纳入国际专家共识，入选2022年度“中国生物信息学十大进展”和“细胞出版社2019中国年度论文”。主持多项国家自然科学基金，担任国家重点研发计划研究骨干。获中国抗癌协会科技奖一等奖、北大医学青年科技奖、国际肿瘤转移协会青年研究员奖、中国肿瘤标志物学会青年科学家论文特等奖、中国棒棰岛肿瘤前沿论坛青年创新一等奖。担任国际胆管癌协会会员，中国抗癌协会肿瘤微环境专委会委员和肿瘤标志物专委会青委等。

研究方向

聚焦肿瘤基因组学研究，深度结合单细胞/空间/多组学等新技术、生物信息新方法和功能实验，探究肿瘤演化和微环境相互调控的新规律和新机制，发现肿瘤精准诊疗的新靶点和新策略。主要研究方向有：

1） 肿瘤相关中性粒细胞（TAN）的功能异质性、调控机制及诊疗策略

2） 肿瘤全生命周期亚克隆演化规律及调控机制

3） 肿瘤基因组变异、克隆演化与免疫微环境的动态互作

代表性成果

(^#Co-first author, *Co-corresponding author)

1. Xue Ruidong^#, Zhang Qiming^#, Cao Qi^#, Kong Ruirui^#, Xiang Xiao^#, …, Zhu Jiye*, Zhang Zemin*, Zhang Ning*. Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity. Nature 2022; 612(7938): 141-147. “2022 年度中国生物信息学十大进展”

2. Chen Lei^#, Zhang Chong^#, Xue Ruidong^#, …, Steven G Rozen*, Bai Fan*, Wang Hongyang*. Deep whole-genome analysis of 494 hepatocellular carcinomas. Nature 2024.

3. Guo Lin^#, Yi Xianfu^#, Chen Lu^#, …, Xue Ruidong*, Zhang Ning*. Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma. Gastroenterology 2022;162:238-252. Editorial by Gastroenterology

4. Xiang Xiao^#, Liu Ziyang^#, Zhang Chong^#, Li Zhao^#…, Xue Ruidong*, Bai Fan*, Zhu Jiye*. IDH mutation subgroup status associates with intratumor heterogeneity and the tumor microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma. Advanced Science 2021;8:e2101230.

5. Xue Ruidong^#, Chen Lu^#, Zhang Chong^#, Fujita Masashi^#, …, Nakagawa Hidewaki*, Zeng Mu-Sheng*, Bai Fan*, Zhang Ning*. Genomic and transcriptomic profiling of combined hepatocellular and intrahepatic Cholangiocarcinoma Reveals Distinct Molecular Subtypes. Cancer Cell (2019); 35: 932-947 e8. Preview by Cancer Cell, News and Views by Nat Rev G&H,“CellPress 2019中国年度论文”

6. Xue Ruidong^#, Li Ruoyan^#, Guo Hua^#, Guo Lin^#, …, Zhang Zemin, Xie Sunney Xiaoliang, Bai Fan*, Zhang Ning*. Variable intra-tumor genomic heterogeneity of multiple lesions in patients with hepatocellular carcinoma. Gastroenterology (2016); 150: 998-1008. (^#Co-first author) Editorial by Gastroenterology

7. Zhang Chong ^#, Zhang Lin ^#, Xu Tianlei ^#, Xue Ruidong ^#, …, Bai Fan*, Zhang Haizeng*. Mapping the spreading routes of lymphatic metastases in human colorectal cancer. Nature Communications (2020); 11: 1993.

8. Dong Xin, Xue Ruidong. Capture a live-photo of tumor infiltrating T cell landscape at single cell resolution. Cancer Biology & Medicine (2019); 16: 619-622.  封面论文

9. Xue Ruidong^#, Ma Qi^#, Baker A. Matthew*, Bai Fan*. A Delicate Nanoscale Motor Made by Nature-The Bacterial Flagellar Motor. Advanced Science (2015); 2: 1500129. (^#Co-first author)

10. Xue Ruidong, Li Ruoyan, Bai Fan. Single cell sequencing: technique, application, and future development. Science Bulletin (2015); 60: 33-42.